Niko Tatopoulos es un biólogo norteamericano que estudia los efectos de las radiaciones de Chernobyl en los organismos vivos y que es consultado por el coronel Hicks para que opine acerca de un misterioso ataque a un barco japonés. Sus conclusiones le llevan a pensar que algo de proporciones gigantescas y origen reptiliano es el causante de la catástrofe, probablemente una criatura mutante producto de las pruebas nucleares de los franceses en el Pacífico. Un marino que ha sido testigo del suceso confirma las sospechas cuando repite histéricamente sin parar el nombre de Godzilla. La enorme y legendaria lagartija se dirige ahora hacia un nuevo objetivo: la ciudad de Nueva York.